Eigentlich unerklärlich wieso Winamp zickt, normalerweise sollten er 48000er Files abspielen.Lad dir WAV2LAME und Lame herunter, entpacke alles in den selben Ordner und starte W2L.exe. Im Feld Switches --resample 44.1 eingeben, MP3s laden, einen anderen Output folder wählen und Encode klicken.
Wenn Winamp immer noch zickt kann es eventuell an einem Plugin liegen.